Research Scientist (AI) - Interactome
On site
Paris, France
Full Time
25-03-2025
Job Specifications
Genbio. AI, Inc. (GenBio AI) is an innovative global startup dedicated to developing foundation models (FM) for biology.
We aim to train transformative FMs on pan-modal biological data at all levels. Our goal is to achieve comprehensive, actionable empirical understandings of the mechanisms underlying all organismal physiologies and diseases. This will pave the way for a new paradigm in drug design, bio-engineering, personalized medicine, and fundamental biomedical research, all powered by Generative Biology.
Our founding team consists of world-renowned scientists and researchers in AI and Biology from prestigious institutions such as CMU and Stanford, alongside prominent financial investors.
Our management team boasts strong technical and managerial backgrounds, hailing from top academic institutions in the US and France, including CMU, ENS, L’X, and Inria, as well as leading tech companies like Isomorphic and Meta. Additionally, our advisory board features Nobel Prize Laureates in Chemistry, Medicine, and Economics, Turing Award Laureates, and senior policymakers from the US and UK.
GenBio AI a true global effort from day one, is establishing offices in Palo Alto, Paris, and Abu Dhabi.
Job Requirements
PhD (or evidence of equivalent level of expertise) in Computer Science, Artificial Intelligence, Machine Learning, or a related technical field
Proven track record in research and innovation demonstrated through contributions in top-tier AI/ML (e.g., NeurIPS, ICML, CVPR, ECCV, ICCV, ICLR) and/or core biology (e.g., Nature, Science, or Cell) journals and conferences
Skilled in developing, implementing, and debugging deep learning methods/models in popular frameworks, such as JAX, TensorFlow, or PyTorch, with an interest in generative models, graph neural networks, or large-scale deep learning applications
A strong theoretical foundation (statistics, optimization, graph algorithms, linear algebra) with experience building models ground up
A passion for interdisciplinary research (with an emphasis on the intersection of AI and Biology), and willingness to acquire necessary domain knowledge
Motivated and self-driven with the ability to operate with partial and incomplete descriptions of high-level objectives (as is typical in a start-up environment)
Evidence of familiarity and utilization of software engineering best practices (version controlling, documentation, etc), and open-source contributions, especially if used by others
Qualifications
3+ years of post-PhD experience in an industry or postdoc role
Prior experience working at either a start-up or top research industry labs (e.g., OpenAI, FAIR, Deepmind, Google Research)
Hands-on prior experience working at the intersection of AI and Biology
Experience in large-scale distributed training and inference, ML on accelerators
Preferred Qualifications
Prior experience working with diverse biological datasets, including but not limited to bulk/single transcriptomics (e.g., RNA-Seq), epigenetic (e.g., ATAC/ChIP-Seq), proteomics/phosphoproteomics (e.g., mass-spec), and genetics (e.g., GWAS) datasets
Familiarity with diverse biological networks, including but not limited to protein-protein interaction, gene-gene expression, and TF-Target Gene regulatory networks
Prior experience developing algorithms for network/systems biology (e.g., network construction/inference, clustering, embedding, etc)
Familiarity with Graph ML frameworks, such as Pytorch Geometric, Deep Graph Library (DGL), and Nvidia RAPIDS (cuGraph/cuML)
Hands-on experience with geometric deep learning models such as Graph Convolutional Networks (GCN) and Graph Attention Networks (GAT)
Familiarity with traditional (e.g., TransE, RotatE, etc.) and deep (ULTRA) representation learning algorithms for large knowledge graphs
Join us as we embark on this journey to redefine the future of biology and medicine.
We are an equal opportunity employer. We celebrate diversity and are committed to creating an inclusive environment for all employees.
About the Company
GenBio.AI, Inc. (GenBio AI) is an innovative global startup dedicated to developing the world's first AI-driven Digital Organism, an integrated system of multiscale foundation models for predicting, simulating, and programming biology at all levels. Our goal is to achieve comprehensive, actionable empirical understandings of the mechanisms underlying all organismal physiologies and diseases. This will pave the way for a new paradigm in drug design, bio-engineering, personalized medicine, and fundamental biomedical research,... Know more
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- QUI SOMMES-NOUS ? Construisons ensemble un avenir de confiance Thales est un leader mondial des hautes technologies spécialisé dans trois secteurs d’activité : Défense & Sécurité, Aéronautique & Spatial, et Cybersécurité & Identité numérique. Il développe des produits et solutions qui contribuent à un monde plus sûr, plus respectueux de l’environnement et plus inclusif. Le Groupe investit près de 4 milliards d’euros par an en Recherche & Développement, notamment dans des domaines clés de l’innovation tels que l’IA, la cybersécurité, le quantique, les technologies du cloud et la 6G. Thales compte près de 81 000 collaborateurs dans 68 pays. Nos engagements, vos avantages Une réussite commune portée par notre culture et excellence technologique, votre expérience et notre ambition partagée Un package de rémunération attractif (épargne salariale, variable ou 13ième mois selon les postes, restaurant d’entreprise,…) La possibilité de développer vos compétences en continu grâce à nos parcours de formation et nos académies internes #ENTREPRISEAPPRENANTE Notre attention portée à votre équilibre personnel et professionnel (Accord télétravail, RTT, congés d’ancienneté, jours enfants malades, guide parentalité, crèches, CSE / ASC,… ) Des communautés internes permettant de vous engager sur les sujets qui vous tiennent à cœur : innovation, diversité, environnement Un environnement inclusif et bienveillant où vous êtes accueilli et valorisé avec notre politique handi-accueillante, notre charte LGBT+, notre initiative #StOpe pour lutter contre le sexisme. Thales propose des systèmes d’information et de communication sécurisés et interopérables pour les forces armées, les forces de sécurité et les opérateurs d’importance vitale. Ces activités, qui regroupent radiocommunications, réseaux, systèmes de protection, systèmes d’information critiques et cybersécurité, répondent aux besoins de marchés où l’utilisation des nouvelles technologies numériques est déterminante. Thales intervient tout au long de la chaîne de valeur, des équipements aux systèmes en passant par le soutien logistique et les services associés. Face à la montée en puissance de la cybercriminalité, favorisée par la complexité croissante des systèmes et des réseaux, la Direction de la Sécurité des Technologies de l’Information développe et soutient des solutions de sécurité de haut niveau pour les systèmes d’information et de communication des organisations internationales, des gouvernements, des opérateurs d’infrastructures critiques. En collaboration étroite avec des agences européennes ou d’autres entités Thales, les équipes de Toulouse fournissent les solutions de cybersécurité de programmes spatiaux via ses activités d’ingénierie de sécurité, de conception d’architecture, d’intégration et qualification de solution (SOC), et assurent le support à l’accréditation sécurité avant déploiement, mais aussi la maintenance et le maintien en condition de sécurité. QUI ETES-VOUS ? Diplômé d'un Bac +5 et/ou école d'ingénieur, vous disposez d'une première expérience significative dans le domaine de la sécurité informatique, acquise au travers de premières expérience professionnelle. Au fil des années vous avez acquis une bonne culture de la sécurité des systèmes d’information et de la gouvernance associée, vous avez contribué à la définition, la conception ou la validation d’architectures sécurisées de produits ou de système, vous avez été impliqué dans la réalisation d’analyses de risque ou contribué à des évaluations de sécurité. Votre expérience vous permet de rapidement appréhender un système complexe dans sa globalité, comprendre son architecture et identifier de potentiels problèmes de conception. Vous avez des facilités pour vulgariser des problématiques complexes et les restituer avec pédagogie et rigueur à l’écrit comme à l’oral, à différents types d’audiences (collègues, clients, autorités). Vous êtes à l’aise avec la gestion et la production documentaire en français comme en anglais. Vous savez jouer collectif, travailler en équipe, vous aimez apprendre et partager des connaissances, mais également une forte capacité à appréhender en toute autonomie et responsabilité les missions qui vous seront confiées. CE QUE NOUS POUVONS FAIRE ENSEMBLE : Le CESTI THALES fournit des prestations d'évaluation et d'expertise en sécurité de l'information. Son métier : trouver et exploiter les failles de sécurité dans les produits ou systèmes que lui confient ses clients. Agrées pour les évaluations Critères Communs et CSPN par l'ANSSI (Agence Nationale de la Sécurité des Systèmes d'Information) et par de nombreux schémas d’évaluation privés, l’équipe d’experts intervient sur une multitude de produits allant de la carte à puce à l’équipement satellite. Votre rôle : mener l’analyse de vulnérabilité du produit dans son ensemble, de son processus de fabrication (suivi des exigences) à sa campagne de validation. Vous apprendrez au quotidien et interviendrez en équipe, dans le cadre de projets pluridisciplinaires d’évaluation, par exemple : Evaluation CSPN d’un système de contrôle d’accès Evaluation Critères Communs d’un chiffreur réseau gouvernemental Analyse de sécurité d’un équipement militaire Participation à des groupes de travail internationaux Innovation, passion, ambition : rejoignez Thales et créez le monde de demain, dès aujourd’hui. Le poste pouvant nécessiter d'accéder à des informations relevant du secret de la défense nationale, la personne retenue fera l'objet d'une procédure d’habilitation, conformément aux dispositions des articles R.2311-1 et suivants du Code de la défense et de l’IGI 1300 SGDSN/PSE du 09 août 2021. Thales reconnait tous les talents, la diversité est notre meilleur atout. Postulez et rejoignez nous !